L’agence est organisée en 5 unités :
L’ensemble de l’Agence est orienté et organisé en fonction de ces objectifs, en affirmant les valeurs et perspectives originelles de l’ARPE :
> INNOVATION : l’ARPE a vocation à développer, faire émerger et valoriser des pratiques et des démarches novatrices, dans le prolongement des politiques publiques initiées par les collectivités membres, auprès des acteurs publics et des habitants du territoire régional, que ce soit à des niveaux techniques ou méthodologiques, dans les champs du développement durable.
> ANIMATION : l’ARPE a une mission d’animation auprès des acteurs de l’environnement et du développement durable sur le territoire. Elle anime 7 Réseaux (pour plus de détails : rubrique "Réseaux régionaux") :
- Commande publique & développement durable (CPDD)
- Espace d’échanges des acteurs de l’utilité sociale environnement (EUSE)
- Gestionnaires d’espaces naturels protégés (RREN)
- Gestionnaires de milieux aquatiques (RRGMA)
- Gestionnaires de déchetteries (RRGD)
- Territoires durables (RTD)
- Zones d’activités & développement durable (ZADD)
> MUTUALISATION: l’ARPE est un outil technique. Par ses moyens et ses compétences, l’Agence a vocation à servir les acteurs de son territoire grâce à la mise à disposition d’outils (SIG, systèmes d’observations, gestion…) et de moyens (notamment accompagnement de projets par des chargés de missions).